لتحضير النسيج للقطع يجب غسل المثبت عنه، ثم إزالة الماء منه، وترويقه، وطمره في الشمع ليتشربه خلال خلاياه. وهكذا يعمل الشمع كدعامة داخل النسيج، تُمكّن من قطعه إلى مقاطع يصل سمكها إلى عشرة ميكرومترات. وبعدها، توضع المقاطع على شرائح مجهرية، وتصبغ وتغطى بأغطية زجاجية رقيقة. وفي الحالات الطارئة، التي يُحتاج فيها إلى شرائح بسرعة، كما في الدراسات المرضية، يمكن الاستغناء عن كل ما سبق ذكره في تحضير المقاطع، بتجميد النسيج الذي يسمى خزعة ثم قطعه وصبغه في الحال.